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密花香薷葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進化分析

時間:2022年03月19日 分類:農(nóng)業(yè)論文 次數(shù):

摘要:目的基于高通量測序獲得藥用資源植物密花香薷Elsholtziadensa葉綠體基因組序列,分析了葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及特征,為研究密花香薷資源分類及系統(tǒng)進化奠定了基

  摘要:目的基于高通量測序獲得藥用資源植物密花香薷Elsholtziadensa葉綠體基因組序列,分析了葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及特征,為研究密花香薷資源分類及系統(tǒng)進化奠定了基礎(chǔ)。方法以密花香薷葉片為材料,利用改良的CTAB法提取DNA;采用二代測序技術(shù)IlluminaNovaSeq平臺對葉綠體基因組進行測序;以廣藿香葉綠體基因組為參考序列,進行序列組裝和矯正,得到完整葉綠體基因組序列;利用生物信息學(xué)方法分析密花香薷葉綠體基因組特征并進行系統(tǒng)發(fā)育分析。結(jié)果獲得密花香薷完整葉綠體基因組序列全長149095bp,GC含量37.92%,注釋到130個基因,其中包括85個蛋白質(zhì)編碼基因,8個rRNA基因和37個tRNA基因;密花香薷葉綠體基因組中共檢測到28個散在重復(fù)序列,串聯(lián)重復(fù)序列共檢測到191個,單核苷酸重復(fù)序列最多,共114個;系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果表明,密花香薷和其他唇形科植物聚合在一起形成一個分支結(jié)構(gòu),紫蘇屬植物和香薷屬植物親緣關(guān)系較近。結(jié)論建立了適于香薷屬植物葉綠體基因組測序及其特征分析的方法,豐富了唇形科植物遺傳資源,為密花香薷分子標記開發(fā)及唇形科屬種間系統(tǒng)發(fā)育分析研究提供了理論基礎(chǔ)。

  關(guān)鍵詞:密花香薷;葉綠體;基因組;分子標記;系統(tǒng)發(fā)育

植物研究

  葉綠體是綠色植物特有細胞器,是細胞能量轉(zhuǎn)換和儲存的場所,遺傳方式以母系為主,所以在植物中具有種的特異性,其自身擁有一套完整的基因組,重組率低,后代遺傳穩(wěn)定[1-2]。葉綠體基因組在被子植物中具有獨立的蛋白表達系統(tǒng),大小介于1.20×105~1.80×105bp,一般為共價閉合的環(huán)狀結(jié)構(gòu),其結(jié)構(gòu)由4部分組成:包含2個反向重復(fù)區(qū)(invertedrepeats,IRs)、大單拷貝區(qū)(largesinglecopy,LSC)和小單拷貝區(qū)(smallsinglecopy,SSC)4個部分[3]。

  葉綠體基因組相比核基因組包含信息量較小,由于進化模式和分布區(qū)域的差異,不同類群物種間基因組有時會發(fā)生插入/缺失、重復(fù)、倒位、重排等多種類型的結(jié)構(gòu)變異和基因丟失現(xiàn)象,但是,從組成結(jié)構(gòu)、基因類型和數(shù)目及排列順序來看,葉綠體基因組較穩(wěn)定,具有保守性,長度較小,易于測序,而且葉綠體基因組核苷酸進化速率較低,因此在植物不同分類階段的系統(tǒng)發(fā)育分析中具有廣發(fā)的應(yīng)用,葉綠體基因組和其CDS基因片段變異分析常被用于分析物種種群遺傳結(jié)構(gòu)分化及動態(tài)歷史發(fā)展規(guī)律[4-7]。

  煙草NicotianatabacumL.[8]和地錢MarchantiapolymorphaL.[9]2個物種葉綠體基因組測序報道,是人類首次獲得綠色植物葉綠體基因組序列信息。二代測序技術(shù)的不斷完善和推廣,為植物葉綠體基因組相關(guān)研究提供了技術(shù)支持,為后續(xù)植物資源分類和鑒定、系統(tǒng)發(fā)育、譜系地理學(xué)、及野生植物資源利用和保護方面的研究提供了有效的途徑[10-12]。

  密花香薷ElsholtziadensaBenth.在中國西北地區(qū),如陜西、四川、云南、甘肅、青海、西藏等地廣泛分布,其外觀形態(tài)和紫蘇接近,所以又稱之為野紫蘇,屬唇形科(Labiatae)香薷屬ElsholtziaL.一年生草本植物,生境多樣化,農(nóng)田、林緣、高山、草地邊緣、林下、河邊、荒地等海拔1800~4200m的范圍內(nèi)均有分布[13-14]。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),密花香薷全草可入藥,具有發(fā)汗解暑、行水散濕、溫胃調(diào)中的功效,且據(jù)現(xiàn)代藥理研究,香薷類植物揮發(fā)油具有廣譜抗菌和殺菌作用,并有直接抑制流感病毒的作用[15-16]。密花香薷亦可作為蜜源,養(yǎng)蜂價值極高[17]。所以密花香薷具有重要的藥用和經(jīng)濟價值。

  目前,有關(guān)密花香薷生藥學(xué)或化學(xué)成分提取和分離相關(guān)研究較多[16,18-24],蜜腺的解刨學(xué)結(jié)構(gòu)研究比較古老[25],但關(guān)于密花香薷資源分類、居群分布規(guī)律、生理特性,尤其是分子生物學(xué)方面的相關(guān)研究還無人涉及。本研究以分布在青藏高原的密花香薷為材料,使用二代測序技術(shù)獲得密花香薷葉綠體全基因組序列信息,利用生物信息學(xué)相關(guān)軟件,分析其葉綠體基因組構(gòu)成和特征,不僅可豐富唇形科植物遺傳信息,也為后續(xù)密花香薷資源分類和鑒定、遺傳多樣性、種群歷史動態(tài)發(fā)展和香薷屬植物間的系統(tǒng)發(fā)育與親緣關(guān)系研究奠定了基礎(chǔ)。

  1材料

  用于本研究的密花香薷樣本,采于青海省共和縣青海湖二郎劍景區(qū)(N100.4911°,E36.5785°,海拔3194m),采取生長狀況良好的幼嫩葉片,液氮冷存,帶回青海民族大學(xué)于−80℃冷凍保存,用于DNA提取。植物憑證樣本保存于青海民族大學(xué)生態(tài)環(huán)境與資源學(xué)院(FGE20197201)。

  2方法

  2.1全基因組DNA提取及測序

  經(jīng)典CTAB法用于樣品DNA提取,瓊脂糖凝膠電泳判斷樣本DNA的完整性,微量核酸測定儀(NanoDrop2000)檢測其質(zhì)量和DNA含量。若樣品基因組DNA檢測結(jié)果符合實驗要求,對基因組DNA進行片段化處理,用到的方法一般為機械打斷法即超聲波法,下一步是對片段化DNA進行純化和末端修復(fù),還需在3′端加A、連接測序接頭,對上述處理完的DNA片段需進行片段長度分選,最后進行PCR擴增構(gòu)建測序文庫,對測序完成的文庫需進行質(zhì)量檢測,質(zhì)檢合格的文庫用IlluminaNovaSeq平臺進行測序,測序讀長為PE150。

  為確保序列組裝過程中的準確性,必須對原始獲得的rawreads序列進行一系列處理,主要是去除測序時連接的接頭以及擴增時的引物序列;篩選出高質(zhì)量的數(shù)據(jù),保證數(shù)據(jù)質(zhì)量(質(zhì)量值Q≤5的堿基數(shù)占整個read的50%以上的reads)。通過前期處理和質(zhì)量控制之后最終獲得高質(zhì)量的cleandata。

  使用bowtie2v2.2.4比對南京集思慧遠公司自建的葉綠體基因組數(shù)據(jù)庫,將比對上的測序序列當作樣品的葉綠體基因組測序序列(cpDNA序列)。組裝核心模塊采用SPAdesv3.10.1軟件組裝葉綠體基因組,組裝不依賴參考基因組。使用SPAdes軟件對上述cleanreads進行基因組拼接,將拼接結(jié)果與PogostemoncablinBenth.葉綠體基因組(MF287372.1)進行blast比對,基因組比對參考序列,查看基因組的保守與重排等共線性分析;基因組比對參考序列結(jié)構(gòu)信息,比較兩者間的差異。

  2.2葉綠體基因組注釋和基因分析

  使用blastv2.2.25軟件比對NCBI數(shù)據(jù)庫的葉綠體基因組cds序列,手工校正后得到葉綠體基因組基因注釋結(jié)果。使用hmmerv3.1b2軟件比對NCBI數(shù)據(jù)庫葉綠體基因組rRNA序列,得到葉綠體基因組的rRNA注釋信息。使用aragornv1.2.38軟件對葉綠體基因組序列進行tRNA的預(yù)測,得到葉綠體基因組tRNA注釋信息。最后使用OGDRAW制作葉綠體基因組完整圖譜。利用CodonW1.4.2軟件對密花香薷葉綠體基因組密碼子偏好性(RSCU,relativesynonymouscodonusage)進行分析和統(tǒng)計。

  2.3散在重復(fù)序列及cpSSR

  分析葉綠體基因組中的重復(fù)序列根據(jù)不同的分布模式分為2種類型即散在重復(fù)序列和串聯(lián)重復(fù)序列,散在重復(fù)序列多是失活的轉(zhuǎn)座元件,在基因組中呈分散式分布,簡單重復(fù)序列(simplesequencerepeats,SSR)標記,是一類由幾個核苷酸(一般為1~6個)為重復(fù)單位組成的長達幾十個核苷酸的串聯(lián)重復(fù)序列。使用vmatchv2.3.0軟件鑒定散在重復(fù)序列。葉綠體基因組中含有不同重復(fù)類型的串聯(lián)重復(fù)序列,一般稱之為稱之為cpSSR。

  使用MISAv1.0(MIcroSAtelliteidentificationtool)軟件進行cpSSR的分析,參數(shù)1-8(單堿基重復(fù)8次及以上)、2-5、3-3、4-3、5-3、6-3,2個SSR序列之間的最小距離設(shè)置為100bp。

  2.4基于葉綠體基因組序列系統(tǒng)進化分析

  搜索NCBI數(shù)據(jù)庫,選取已公開的唇形科,不同屬植物共18種[虎尾紫蘇Perillafrutescensvar.hirtellaMakinoetNemoto(KT220691.1)、檸檬紫蘇P.citriodoraNakai(KT220690.1)、P.setoyensisG.Honda(KT220692.1);海州香薷E.splendensNakaiexF.Maekawa(MH700782.1);OcimumtenuiflorumL.(NC043873.1)、羅勒O.basilicumL.(NC035143.1);丹參SalviamiltiorrhizaBge.(JX312195.1)、鼠尾草S.japonicaThunb.(NC035233);夏枯草PrunellavulgarisL.(NC039654.1);掌葉青蘭DracocephalumpalmatumC.Y.Wu(NC031874.1);留蘭香MenthaspicateL.(NC037247.1)、歐薄荷M.longifoliaL.(NC032054.1)、黃芩ScutellariabaicalensisGeorgi(MF521633.1)、S.insignisNakai(NC028533.1);廣霍香P.cablinBenth.(MF287372.1);棉毛水蘇StachysbyzantinaC.KochNC029825.1)、林地水蘇S.sylvaticaL.(NC029824.1、紅花水蘇S.coccineaJacq.(NC029823.1),下載其序列,以茄科的黑果枸杞LyciumruthenicumMurr.(NC039651.1)為外類群。

  3結(jié)果與分析

  3.1葉綠體基因組結(jié)構(gòu)基本特征

  密花香薷葉綠體基因組經(jīng)測序,去掉低質(zhì)量reads后得到cleanreads22864493個片段,Q20為96.91%,GC含量為39.64%[26]。GC含量也可反應(yīng)葉綠體基因組組成特征,本研究檢測到密花香薷葉綠體基因組GC含量37.92%,遠低于AT含量(62.08%),說明具有綠色植物葉綠體基因組普遍AT偏向性的特征[26]。

  其中IR區(qū)序列包含有4個編碼rRNA的基因,所以GC含量(43.16%)明顯高于LSC區(qū)(35.96%)和SSC區(qū)(31.92%)[26]。使用SPAdes軟件進行基因組片段的拼接,拼接完成的序列與參考序列(accession:MF287372.1)比對,進行組裝完成后的質(zhì)量檢控。最終得到密花香薷葉綠體基因組,全長149095bp,其結(jié)構(gòu)與大多數(shù)被子植物相同,為環(huán)狀雙鏈分子,呈典型的四段式結(jié)構(gòu)(圖1)。其中,LSC結(jié)構(gòu)區(qū)長度為81497bp,SSC結(jié)構(gòu)區(qū)長度為17364bp,2個反向互補重復(fù)區(qū)IR分別長25117bp[26]。

  3.2基因注釋及歸類分析

  密花香薷葉綠體基因組共檢測到129個基因,其中包括84個蛋白質(zhì)編碼基因,8個rRNA基因和37個tRNA基因。其中有17個基因在IRs區(qū)重復(fù),包含6個蛋白編碼基因(ndhB、rpl2、rpl23、rps12、rps7、ycf2),4個rRNAs基因(rrn16、rrn23、rrn4.5、rrn5)7個tRNA基因(trnA-UGC、trnI-CAU、trnI-GAU、trnL-CAA、trnN-GUU、trnR-ACG、trnV-GAC);SSC區(qū)包括12個蛋白編碼基因,1個tRNA基因;LSC區(qū)包含60個蛋白編碼基因,22個tRNA基因。

  密花香薷葉綠體基因組中大多數(shù)蛋白質(zhì)編碼基因由1個外顯子組成,共有15個基因(atpF、ndhA、ndhB、petB、petD、rpl2、rpl16、rpoC1、trnA-UGC、trnG-UCC、trnH-GUG、trnI-GAU、trnK-UUU、trnL-UAA、trnV-UAC)包含1個內(nèi)含子,3個基因(rps12、clpP、ycf3)包含2個內(nèi)含子。編碼基因根據(jù)其產(chǎn)物功能的不同分為以下幾種類型:(1)光合作用相關(guān)基因;(2)自身翻譯相關(guān)基因;(3)其他基因;(4)未知功能相關(guān)基因。

  3.3葉綠體基因組密碼子偏好性分析

  對密花香薷葉綠體密碼子研究發(fā)現(xiàn),共檢測到26160個密碼子,其中編碼亮氨酸(Leu)的密碼子數(shù)量最多,有3397個,占總密碼子數(shù)的12.99%;編碼半胱氨酸Cys的最少,有299個,占總密碼子數(shù)的1.15%。相對同義密碼子(relativesynonymouscodonusage,RSCU)使用度最高的為AUG(2.9901),最低的是CUG/GUG(0.0048)。32個密碼子RSCU值大于1.00,其中,29個密碼子堿基構(gòu)成以A或U結(jié)尾,其余4個以G或C結(jié)尾。

  3.4葉綠體基因組重復(fù)序列分析

  28個散在重復(fù)序列在密花香薷葉綠體基因組中被檢測到。串聯(lián)重復(fù)序列共檢測到191個,單核苷酸重復(fù)序列最多,共114個,主要以A(51)和T(56)堿基重復(fù)為主,單核苷酸T重復(fù)序列最長,為14bp,單核苷酸串聯(lián)重復(fù)序列長度占總序列長度的0.6855%,3堿基串聯(lián)重復(fù)序列總數(shù)為55個,2堿基重復(fù)序列和4堿基重復(fù)序列最少為5個,復(fù)合型重復(fù)序列12個,串聯(lián)重復(fù)序列長度介于8~26bp,串聯(lián)序列總長度為1885bp,占葉綠體基因組序列總長度的1.2643%。

  基因編碼區(qū)包含的SSR序列位點總數(shù)達84個和分布于基因間隔區(qū)(IGS)的SSR序列位點數(shù)相同,位于內(nèi)含子區(qū)域(Intron)的為21個,其余2個分布于間隔區(qū)和基因編碼區(qū)。密花香薷SSRs位點在葉綠體基因組中分布不均勻,多態(tài)性較高,為后續(xù)SSR分子標記的開發(fā)提供了理論依據(jù)。

  3.5基于葉綠體基因組的密花香薷系統(tǒng)發(fā)育分析

  總共選取了唇形科10個屬,共18種植物葉綠體全基因組序列(括號內(nèi)為物種數(shù)目),紫蘇屬(3)、香薷屬(1)、羅勒屬(2)、鼠尾草屬(2)、夏枯草屬(1)、青蘭屬(1)、薄荷屬(2)、黃芩屬(2)、刺蕊草屬(1)、水蘇屬(3),外類群1個,加上本研究所測密花香薷葉綠體基因組共20個種,構(gòu)建了NJ系統(tǒng)發(fā)育樹。系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果顯示,“密花香薷”與其他唇形科植物聚在一起形成一個大的分支。

  19種唇形科植物形成2個大亞支,且分支支持率高(BP=100),第I大亞支(BP=100)由2個分支構(gòu)成,其中一個分支包含2個亞支,一個亞支由2個分支構(gòu)成,紫蘇屬3個物種形成一個單獨分支聯(lián)合海州香薷和密花香薷形成1個分支,另一 分支由羅勒屬2個物種單獨構(gòu)成;另一亞支由鼠尾草屬2個物種單獨形成的一個分支和夏枯草屬、青蘭屬和薄荷屬6個物種形成的另一分支構(gòu)成。第II大亞支(BP=100)由黃芩屬2個物種單獨形成的一個分支和刺蕊草屬1個物種、水蘇屬3個物種聯(lián)合形成的另一姐妹分支構(gòu)成。除密花香薷和海洲香薷Elsholtziasplendens外,同屬物種均匯聚在一起形成姐妹分支。

  4討論

  被子植物質(zhì)體DNA通常為母系遺傳,因其在進化過程中不經(jīng)歷基因重組,通過對其序列結(jié)構(gòu)組成,特征及變異分析,可以很好地揭示物種系統(tǒng)發(fā)育過程[27]。尤其二代高通量測序技術(shù)的不斷優(yōu)化,極大地提高了測序效率,降低了測序費用,使植物葉綠體基因組測序在許多物種遺傳研究中被頻繁使用。

  有報道研究表明,葉綠體基因組結(jié)構(gòu)為雙鏈環(huán)狀DNA分子結(jié)構(gòu),由4部分構(gòu)成,包含LSC、SSC和2個IR,其中2個IR區(qū)序列相同,方向相反[8]。測序獲得的基因組長度介于1.20×105~1.80×105bp,檢測到的編碼基因數(shù)為100~130,蛋白編碼基因數(shù)最多為70~80,30~32種不同類型的tRNA編碼基因被檢測到,rRNA編碼基因數(shù)比較穩(wěn)定,通常有4種[28]。

  本研究所獲得密花香薷葉綠體基因組大小和結(jié)構(gòu)與上述被子植物研究結(jié)果相符。香薷屬植物約有40余種,我國分布有33種,但是有關(guān)本屬葉綠體基因組測序的報道較少,目前只有2個物種被報道,一個是海州香薷,另一個是本研究所測得密花香薷,比較兩個物種葉綠體基因組組成和特征發(fā)現(xiàn),各個區(qū)段組成及GC含量差異不大。密花香薷基因組GC含量為37.92%,海州香薷為37.8%[29],葉綠體基因組的總體進化速度較慢,在同屬內(nèi)植物表現(xiàn)出保守性。對測得的葉綠體基因組進行了基因功能注釋,共注釋到130個基因,檢測到了84個蛋白編碼基因,其中有4種rRNA基因被檢測到。密花香薷tRNAs基因數(shù)(37)與海州香薷(38)僅相差1個。

  前人研究表明,不同植物所檢測到的tRNAs基因數(shù)變異較大,同一科內(nèi)其tRNA基因數(shù)目存在較大差異,如殼斗科(Fagacea)植物葉綠體基因tRNA基因數(shù)目介于29~46[4],五加科(Araliaceae)植物葉綠體基因組tRNA基因數(shù)目介于29~38[30],但rRNA基因數(shù)目比較保守,如裸子植物臭柏JuniperussabinaAnt.[5]、惠水金橘CitruserythrosaHort.exTan.[31]、鹽樺BetulahalophilaChingexP.C.Li[32]、殼斗科(Fagacea)植物[4]等rRNA基因數(shù)目和類型相同,均為為4種(rrn4.5、rrn5、rrn16、rrn23),分布在IRs區(qū),先前報道的海州香薷和本研究檢測到的密花香薷rRNA基因數(shù)目和類型與上述研究相同。葉綠體基因組差異主要是由反向重復(fù)區(qū)的變異引起的,而IR在穩(wěn)定葉綠體基因組結(jié)構(gòu)和影響葉綠體基因組大小方面起著非常重要的作用[5]。

  位于IRs的ycf1、ycf15、ycf68基因編碼區(qū)內(nèi)有終止密碼子,所以被稱為假基因[33],這幾個假基因在不同種之間表現(xiàn)出廣泛的變異性,密花香薷和海州香薷主要差異也分布在IRs區(qū),本研究密花香薷未檢測到y(tǒng)cf15、ycf682個基因,但在海州香薷中被檢測到。密花香薷基因分布和很多被子植物研究結(jié)果一致,編碼基因主要分布在LSC區(qū),大多數(shù)的基因只含有一個外顯子,單拷貝基因居多,17個基因在IRs區(qū)重復(fù)。

  編碼蛋白和其他被子植物一樣,根據(jù)其功能主要分為3類,(1)光合作用相關(guān)基因;(2)自身翻譯相關(guān)基因;(3)其他基因;(4)未知功能相關(guān)基因[34]。唇形科(Lamiaceae)全球分布有245屬7500余種,被認為是被子植物的第6大科,其中包含許多常見的芳香族植物和藥用植物,具有巨大的經(jīng)濟價值。葉綠體基因組因具有較強的穩(wěn)定性和保守性,所以常被用于系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建。

  Li等[35]基于葉綠體基因組對Harley等2004年提出的唇形科的分類進行了糾正,但是唇形科內(nèi)部的許多種屬系統(tǒng)進化關(guān)系還需進一步得到解決。目前有關(guān)唇形科植物葉綠體全基因組測序報道較少,相關(guān)科及亞科內(nèi)部系統(tǒng)進化關(guān)系構(gòu)建主要利用葉綠體基因組內(nèi)部的個別功能基因如Matk、rbcl、ndhF。

  本研究以已測得的密花香薷葉綠體基因組聯(lián)合NCBI下載的18種唇形科植物葉綠體基因組序列構(gòu)建了NJ進化樹,結(jié)果表明,該進化樹的分辨率較高,各節(jié)點也獲得了較高的支持率,唇形科內(nèi)屬間呈現(xiàn)出較為明確的發(fā)育關(guān)系,同一屬內(nèi)物種呈明顯的姐妹關(guān)系。

  本研究所下載的18個物種序列中,除羅勒屬2個物種為羅勒亞科(Ocimoideae)外,其余均為野芝麻亞科(Lamioideae),進化樹上并沒有將2個亞科明顯區(qū)分,羅勒屬2個物種和紫蘇屬及香薷屬聚合形成一個分支,表現(xiàn)出較近的親緣關(guān)系,但分支支持率較低(BP=75)。

  沈立群[36]對唇形科藥用植物葉綠體基因組進行系統(tǒng)進化分析時發(fā)現(xiàn),羅勒OcimumbasilicumL.和PerillasetoyensisL.(紫蘇屬植物)兩者之間呈姐妹關(guān)系,ML分析及MP分析給出的支持率均不高(LB=75,PB=75),這一結(jié)論與本研究相同。香薷屬和紫蘇屬2個物種表現(xiàn)出較近的親緣關(guān)系,這一結(jié)果和已報道海州香薷葉綠體基因組系統(tǒng)進化關(guān)系分析一致。海州香薷和密花香薷雖為同一屬物種,但并未形成姐妹分支,可能是2個種形態(tài)和分布差異較大的原因。

  本研究首次對密花香薷葉綠體基因組進行測序組裝,并對其基因結(jié)構(gòu)、密碼子偏好性、SSRs數(shù)量及分布和基因功能等進行了分析,結(jié)合已公布的唇形科物種葉綠體基因組序列,構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹,闡明了密花香薷和唇形科內(nèi)不同屬物種之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,不僅豐富了唇形科植物的遺傳資源,也為從分子水平進行植物分類和深入了解植物進化和系統(tǒng)發(fā)育提供了有效的途徑,這對于密花香薷植物的分類和開發(fā)研究提供了理論依據(jù)。

  參考文獻

  [1]DouglasSE.Plastidevolution:Origins,diversity,trends[J].CurrOpinGenetDev,1998,8(6):655-661.

  [2]BirkyCWJr.Uniparentalinheritanceofmitochondrialandchloroplastgenes:Mechanismsandevolution[J].ProcNatlAcadSciUSA,1995,92(25):11331-11338.

  [3]蔣達和.葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)研究進展[J].生物化學(xué)與生物物理進展,1990,17(1):10-14.

  [4]張妍彤,黃劍,宋菊,等.殼斗科植物葉綠體基因組結(jié)構(gòu)及變異分析[J].植物研究,2018,38(5):757-765.

  [5]路東曄,張磊,郝蕾,等.臭柏葉綠體基因組結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)進化分析[J].西北植物學(xué)報,2018,38(8):1464-1475.

  [6]NockCJ,WatersDL,EdwardsMA,etal.ChloroplastgenomesequencesfromtotalDNAforplantidentification[J].PlantBiotechnolJ,2011,9(3):328-333.

  [7]王玲,董文攀,周世良.被子植物葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)變異研究進展[J].西北植物學(xué)報,2012,32(6):1282-1288.

  作者:富貴1,2,3,劉晶1,李軍喬1,2,3*

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